手动删除模块之间的关系：
测试一 ：
第一步：手动删除在模块生成器中新建的模块之间的关系，删除三个文件，
1）
custom\metadata\mark_relationship1_mark_relationship2MetaData.php
2 ) custom\Extension\modules\mark_relationship1\Ext\Vardefs\mark_relationship1_mark_relationship2_mark_relationship1.php
3 )
custom\Extension\modules\mark_relationship2\Ext\Vardefs\mark_relationship1_mark_relationship2_mark_relationship2.php
第二步：
并要在custom\application\Ext\TableDictionary注释掉include(‘custom/metadata/mark_relationship1_mark_relationship2MetaData.php‘);
第三步：
在主界面中，执行一下步骤，系统管理》》修复》》快速修複和重建即可。
测试结果：成功删除工作室的模块之间的关系，在工作室中已经找不到对应模块之间的关系。但是注意，这样并不会影响模块生成器中的关系！（后来经过测试，有问题，不能部署，出现警告，到系统管理》》修复》》快速修複和重建，把相关缓存清除，就可以重新正常部署了！）
如果使用模块生成器重新部署模块，会出现错误，错误如下图：
测试二：
手动删除在系统自带的模块之间的关系，
第一步：
删除一个文件：
metadata\ accounts_contactsMetaData.php
第二步：
修改modules\ TableDictionary.php注释掉include("metadata/accounts_contactsMetaData.php");
第三步：
执行接下来的步骤，系统管理》》修复》》快速修複和重建即可
原文：http://www.cnblogs.com/casney/p/4694556.html