问题出现在升级php版本以后，网站无法连接数据库，phpMyAdmin无法登录：
然后尝试开启mysql，/etc/init.d/mysqld start ，提示：
Starting MySQL. ERROR! The server quit without updating PID file (/usr/local/mysql/data/AY12122808152158ea209.pid).
在/usr/local/mysql/data 下找到mysql错误文件 ****.err，浏览到最后面，发现有一句：
./mysql-bin.index‘ not found (Errcode: 13)
提示./mysql-bin.index无法找到（由于mysql开启了bin日志功能），到数据库根目录查看该文件是存在的，可能是文件权限的问题，然后使用下面的命令给数据库目录 /usr/local/mysql/data 赋予 mysql 权限：
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chgrp -R mysql /usr/local/mysql/data && chown -R mysql /usr/local/mysql/data |
再次启动mysql：/etc/init.d/mysqld start ，一切正常。
解决./mysql-bin.index’ not found (Errcode: 13)
原文：http://www.cnblogs.com/mengdeep/p/4848803.html