理解eneityManager的这三个方法的作用和区别，首先需要分清楚PersistenceContext 和 EntityManager.
PersistenceContext:是entity的一个实例。
EntityManager:是和PersistenceContext联系在一起的，被用来创建、删除或者查找一个持久化Entity实例。
换句话来说PersistenceContext可以说成是数据库的缓存。
1.merge
通过entityManager将一个存在的实体“同步到”persistenceContext中。
实体的状态将从其单独的状态转换为受persistenceContext管理的状态。
如果Entity是新创建的，则这个方法类似于persist()这个方法。
如果Entity已经存在的，则只作为更新操作。
2.Flush
将PersistenceContext的信息同步到数据库中。
当触发Flush这个动作的时候，所有的实体都将会被insert/update/remove到数据库中。
数据库不会触发Commit的操作。
3.Refresh
Refresh的作用是从数据库中将Entity的状态进行更新操作。如果Entity和数据库中的数据不一致，将更新数据库中的数据到Entity中。
eneityManager的merge、Flush、Refresh方法
原文：http://www.cnblogs.com/king-/p/4863303.html