1、最重要的区别，存储的数据的重要性不同。
sys：所有oracle的数据字典的基表和视图都存放在sys用户中，这些基表和视图对于oracle的运行是非常重要的，有数据库自己维护，任何用户都不能手动更改。sys用户拥有dba，sysdba，sysoper角色和权限，是oracle权限最高的用户，类似于公司董事长，而system用户类似于公司总经理。
system：用于存放次一级的内部数据，如oracle的一些特性或工具的管理信息。system用户拥有dba，sysdba角色或系统权限。
2、其次的区别，权限的不同。
sys必须以as sysdba或as sysoper形式登陆。
system如果正常登陆，其实就是一个普通的dba用户，但是若以as sysdba登陆，其结果实际上就是sys用户登陆。
原文：http://www.cnblogs.com/lingzhihua/p/4938424.html