1.基本一样。。只是表示不同的tomcat的http路径而已。
root目录默认放的是tomcat自己的一个项目，如：http://localhost:8080/默认访问root项目
对于webapps，tomcat为了方便,默认一个webapps而不用配置http目录和本地文件目录的映射。
还有就是项目不是一定要放在webapps，真正的工作目录根据自己需要，可以在server.xml中配置。。
2.tomcat下的conf文件夹内的server.xml内的host节点配置的
原文：http://www.cnblogs.com/beijingstruggle/p/4952131.html