适用:
(宿主的进化和菌体群落是否存在对应关系?)
数据要求:
词源
Procrustes,
原始古希腊神话里的一个强盗,大力士。他把人抓来之后放在一个铁床上,不符合床的大小就将将人拉伸或剁其头颅手脚,有点中国古语削足适履的意思。
图片来源(https://themossreports.files.wordpress.com/2010/12/procrustes1.jpg)
Procrustes analysis分析手段
R
library(vegan)>procrustes ()函数
Function procrustes rotates a configuration to maximum similarity with another configuration.
Function protest tests the non-randomness (‘significance’) between two configurations.
Procrustes analysis用于比较两个形状的相似性,将其中一个形状进行旋转以获得与另一个形状的最大相似度。
相近分析方法:
Reference:
http://mb3is.megx.net/gustame/other-methods/procrustes-analysis
Null hypothesis | The degree of concordance between two (or more) matrices is no greater than expected given random inter-matrix associations. |
http://jackson.eeb.utoronto.ca/procrustes-analysis/
原文:http://www.cnblogs.com/bioSci/p/4963278.html