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RNA测序样本检测

时间:2015-12-31 12:18:08      阅读:182      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

常规转录组测序    

样品类型:去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA

 

样品需求量(单次):

  植物和真菌样品:≥20 μg;

  人、大鼠、小鼠样品:≥5 μg;

  其他类型动物:≥10 μg;

  原核生物样品:≥5μg。

样品浓度:

  植物和真菌样品:≥250 ng/μL;
  人、大鼠、小鼠样品:≥65 ng/μL;

  其它类型动物样品:≥150 ng/μL;

  原核生物样品:≥65 ng/μL。

样品纯度:

  真核:OD260/280 =1.8~2.2;OD260/230 ≥2.0;

  动物样品:RIN ≥ 7.0,

  植物样品:RIN ≥6.5,28S:18S ≥1.0;

  昆虫样本无此指标;

  原核生物样品:OD260/280≥1.8;

  OD260/230 ≥1.8;

  RIN ≥6.0,23S:16S≥1.0。

可以分别采用Nanodrop、Qubit 2.0、Aglient 2100方法检测RNA样品的纯度、浓度和完整性等,以保证使用合格的样品进行转录组测序。

RNA测序样本检测

原文:http://www.cnblogs.com/daimakun/p/5091079.html

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