方法1 Eclipse图形化工具：
打开Eclipse后，选择功能菜单里的Windows->Preferences->,弹出对话框后，选择General->Startup and Shutdown->workspace->右视图可以看见workspace中出现的所有路径了！将你要删除的路径选中，然后点击remove就可以了！
方法2 手动修改Eclipse配置：
第一步：删除workspace项目文件夹（根据情况，非必要）
找到目录下的workspace项目文件夹，右键删除文件夹。
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第二步：修改org.eclipse.ui.ide.prefs 文件
打开Eclipse目录的\configuration\.settings目录，找到org.eclipse.ui.ide.prefs 文件，将删除workspace的路径删除。
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第三步：重启Eclipse
重启Eclipse软件后，再点击swith workspace就不会看到已经被删除的workspace了，即我们例子中的test。
Eclipse的switch workspace 选项中删除多余的workspace
原文：http://blog.csdn.net/buaaroid/article/details/51371956
