在工程目录下的.settings文件夹里，打开org.eclipse.wst.common.project.facet.core.xml文件，其内容是：
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<faceted-project>
<runtime name="Apache Tomcat v6.0"/>
<fixed facet="java"/>
<fixed facet="jst.web"/>
<fixed facet="wst.jsdt.web"/>
<installed facet="java" version="1.6"/>
<installed facet="jst.web" version="2.5"/>
<installed facet="wst.jsdt.web" version="1.0"/>
</faceted-project>
第一种方法：
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<faceted-project>
<runtime name="Apache Tomcat v8.0.33"/> //修改为自己的tomcat运行名称即可。
<fixed facet="java"/>
<fixed facet="jst.web"/>
<fixed facet="wst.jsdt.web"/>
<installed facet="java" version="1.6"/>
<installed facet="jst.web" version="2.5"/>
<installed facet="wst.jsdt.web" version="1.0"/>
<installed facet="me.spring" version="3.1"/>
</faceted-project>
第二种方法：
在Myeclipse2013及以上版本，可以在导入项目时，对进行进行迁移，迁移完毕即可解决上述问题。
Target runtime Apache Tomcat v6.0 is not defined
原文：http://www.cnblogs.com/myibm/p/5830628.html