1.定义
标准ＩＯ：标准I/O是ANSI C建立的一个标准I/O模型，是一个标 准函数包和stdio.h头中的定义，具有一定的可移植性。标准IO库处理很多细节。例如缓存分配，以优化长度执行IO等。标准的IO提供了三种类型的缓存。
（1）全缓存：当填满标准IO缓存后才进行实际的IO操作。
（2）行缓存：当输入或输出中遇到新行符时，标准IO库执行IO操作。
（3）不带缓存：stderr就是了。
文件ＩＯ：文件ＩＯ称之为不带缓存的IO（unbuffered I/O)。不带缓存指的是每个read，write都调用内核中的一个系统调用。也就是一般所说的低级I/O——操作系统提供的基本IO服务，与os绑定，特定于*nix平台。
2.区别
首先：两者一个显著的不同点在于，标准I/O默认采用了缓冲机制，比如调用fopen函数，不仅打开一个文件，而且建立了一个缓冲区（读写模式下将建立两个缓冲区），还创建了一个包含文件和缓冲区相关数据的数据结构(FILE *)。低级I/O一般没有采用缓冲，需要自己创建缓冲区，不过其实在*nix系统中，都是有使用称为内核缓冲的技术用于提高效率，读写调用是在内核缓冲区和进程缓冲区之间进行的数据复制。使用标准IO就不需要自己维护缓冲区了，标准IO库会根据stdin/stdout来选择缓冲类型，也就是说当你使用标准IO的时候，要清楚它的stdin/stdou是什么类型以及其默认的缓冲模式，如果不合适，你需要用setvbuf先设置，再使用，例如协同进程的标准输入和输出的类型都是管道，所以其默认的缓冲类型是全缓冲的，如果要使用标准IO，就需要现设置行缓冲。对于文件IO，只要你自己能维护好缓冲区，完全可以不用标准IO。
其次从名字上来区分，文件I/O主要针对文件操作，读写硬盘等，标准I/O，主要是打印输出到屏幕等。因为他们设备不一样，文件io针对的是文件，标准io是对控制台，操作的是字符流。对于不同设备得特性不一样，必须有不同api访问才最高效。
最后来看下它们使用的函数
1.fopen与open
标准I/O使用fopen函数打开一个文件： FILE* fp=fopen(const char* path,const char *mode)
其中path是文件名，mode用于指定文件打开的模式的字符串，比如"r","w","w+","a"等等，可以加上字母b用以指定以二进制模式打开（对于 *nix系统，只有一种文件类型，因此没有区别）,如果成功打开，返回一个FILE文件指针，如果失败返回NULL,这里的文件指针并不是指向实际的文 件，而是一个关于文件信息的数据包，其中包括文件使用的缓冲区信息。
*nix系统使用open函数用于打开一个文件：int fd=open(char *name,int how);
与fopen类似，name表示文件名字符串，而how指定打开的模式：O_RDONLY(只读),O_WRONLY(只写）,O_RDWR （可读可写),还有其他模式请man 2 open。成功返回一个正整数称为文件描述符，这与标准I/O显著不同，失败的话返回-1，与标准I/O返回NULL也是不同的。
2.fclose与close
与打开文件相对的，标准I/O使用fclose关闭文件，将文件指针传入即可，如果成功关闭，返回0，否则返回EOF
比如：
if(fclose(fp)!=0)
printf("Error in closing file");
而*nix使用close用于关闭open打开的文件，与fclose类似，只不过当错误发生时返回的是-1，而不是EOF，成功关闭同样是返回0。C语言用error code来进行错误处理的传统做法。
3.读文件：getc,fscanf,fgets和read
标准I/O中进行文件读取可以使用getc，一个字符一个字符的读取，也可以使用gets（读取标准io读入的）、fgets以字符串单位进行读取（读到遇到的第一个换行字符的后面），gets（接受一个参数，文件指针）不判断目标数组是否能够容纳读入的字符，可能导致存储溢出(不建议使用），而fgets使用三个参数char * fgets(char *s, int size, FILE *stream); 第一个参数和gets一样，用于存储输入的地址，第二个参数为整数，表示输入字符串的最大长度，最后一个参数就是文件指针，指向要读取的文件。最后是fscanf，与scanf类似，只不过增加了一个参数用于指定操作的文件，比如fscanf(fp,"%s",words)
*nix系统中使用read函数用于读取open函数打开的文件，函数原型如下：
ssize_t numread=read(int fd,void *buf,size_t qty);
其中fd就是open返回的文件描述符，buf用于存储数据的目的缓冲区，而qty指定要读取的字节数。如果成功读取，就返回读取的字节数目（小于等于qty）。
4.判断文件结尾
如果尝试读取达到文件结尾，标准IO的getc会返回特殊值EOF，而fgets碰到EOF会返回NULL,而对于*nix的read函数，情况有所不同。read读取qty指定的字节数，最终读取的数据可能没有你所要求的那么多（qty），而当读到结尾再要读的话，read函数将返回0.
5.写文件：putc,fputs,fprintf和write
与读文件相对应的，标准C语言I/O使用putc写入字符，比如：putc(ch,fp);第一个参数是字符，第二个是文件指针。而fputs与此类似：fputs(buf,fp);仅仅是第一个参数换成了字符串地址。而fprintf与printf类似，增加了一个参数用于指定写入的文件，比如：fprintf(stdout,"Hello %s.\n","dennis");切记fscanf和fprintf将FILE指针作为第一个参数，而putc,fputs则是作为第二个参数。
在*nix系统中提供write函数用于写入文件，原型与read类似：ssize_t result=write(int fd,void *buf ,size_t amt);fd是文件描述符，buf是将要写入的内存数据，amt是要写的字节数。如果写入成功返回写入的字节数，通过result与amt的比较可以判断是否写入正常，如果写入失败返回-1
6.随机存取：fseek()、ftell()和lseek()
标准I/O使用fseek和ftell用于文件的随机存取，先看看fseek函数原型int fseek(FILE *stream, long offset, int whence);第一个参数是文件指针，第二个参数是一个long类型的偏移量（offset），表示从起始点开始移动的距离。第三个参数就是用于指定起始点的模式，stdio.h指定了下列模式常量：
SEEK_SET 文件开始处
SEEK_CUR 当前位置
SEEK_END 文件结尾处
看几个调用例子：
fseek(fp,0L,SEEK_SET); //找到文件的开始处
fseek(fp,0L,SEEK_END); //定位到文件结尾处
fseek(fp,2L,SEEK_CUR); //文件当前位置向前移动2个字节数
而ftell函数用于返回文件的当前位置，返回类型是一个long类型，比如下面的调用：
fseek(fp,0L,SEEK_END);//定位到结尾
long last=ftell(fp); //返回当前位置
那么此时的last就是文件指针fp指向的文件的字节数。
与标准I/O类似，*nix系统提供了lseek来完成fseek的功能，原型如下：
off_t lseek(int fildes, off_t offset, int whence); fildes是文件描述符，而offset也是偏移量，whence同样是指定起始点模式，唯一的不同是lseek有返回值，如果成功就 返回指针变化前的位置，否则返回-1。whence的取值与fseek相同：SEEK_SET,SEEK_CUR,SEEK_END，但也可以用整数 0,1,2相应代替。
fseek和ftell == lseek;
原文：http://www.cnblogs.com/hellozyz/p/5957512.html