开启之后，主要会对系统操作、文件、权限设置等方法产生影响，平常项目基本上也用不到这些方法。主要我想还是用来应对webshell吧，减少被人植入webshell所带来的某些安全问题。
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webshell就是以asp、php、jsp或者cgi等网页文件形式存在的一种命令执行环境，也可以将其称做为一种网页后门。黑客在入侵了一个网站后，通常会将asp或php后门文件与网站服务器WEB目录下正常的网页文件混在一起，然后就可以使用浏览器来访问asp或者php后门，得到一个命令执行环境，以达到控制网站服务器的目的。
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safe_mode是提供一个基本安全的共享环境。在一个多用户共享的phpweb服务器上，当这台服务器开启了safe_mode模式，有以下函数将会受到影响。
首先，一下尝试访问文件系统的函数将会被限制，运行服务器的用户id，如果想要尝试操作某个文件，必须要用户该文件的读取或者写入的访问权限。
因此，在safe_mode打开的情况下，下列函数将会收到限制：
ckdir，
move_uploaded_file,
chgrp,
parse_ini_file,
chown,
rmdir,
copy,
rename,
fopen,
require,
highlight_file,
show_source,
include,symlink,
link,
touch,
mkdir,
unlink
以上都是跟操作文件系统有关的函数，除此之外，一些PHP扩展的函数也会受到限制，不能在程序里面直接加载扩展，只能到php.ini里加载，而且php如果需要执行操作系统的程序时，必须在safe_mode_exec_dir中指定程序的路径，否则执行将失败。
此外还有
exec,
shell_exec,
pasathru,
system,
popen等函数会收到限制
http://blog.csdn.net/zqtsx/article/details/9052233
请说明在 php .ini 中 safe_mode 开启之后对于 PHP 系统函数的影响
原文：http://www.cnblogs.com/gengyi/p/6392012.html