我的处理步骤：
第一步：首次确定你的服务可不可以重启，如果可以重启转第二步，如果不可以重启转第三步，这个主要考虑已经部署到客户现场或者正在使用中的数据库不能重启。
第二步：查找mysql的安装路径，这里分安装系统如果是linux系统，可以使用命令 where is mysql 。如果是windows系统尝试了网上的办法，利用sql语句：select @@basedir from dual;但是在mysql too many状态下是无法执行sql的所以这种方法不可行。我也没找到好的方法，我是通过默认安装路径和搜索找到的，一般的安装路径就是C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5。找到路径后更改配置文件，这里有两种一种是在根目录下找到my.ini 文件修改里面的max_connections = 1000 ,wait_timeout = 5
第二种 是修改etc下面的my.conf文件内容同上然后重启服务，打开任务管理器服务名称为mysql的停止服务，再重启服务
至此重启方式的修改完毕。
第三步：其实原则上不存在不重启就能解决，除非你关掉一个正在连接客户端服务。 这里我也简单说说，关闭一个客户端请求（比如说正在请求的程序），让出一个连接，这样你可以通过命令 mysql -h localhost -uroot -p 进入mysql 通过命令 show processlist 找到一个进程id 通过命令 kill id;id代表id号。个人尝试的是重启服务修改配置文件，如果有完全不需要重启的方式解决的求高手讲解。
原文：http://www.cnblogs.com/thunisoft-zxt/p/6971453.html