Window -> Preferences -> General -> Workspace :
Text file encoding :
Default : 选择此项将设定文件为系统默认的编码格式，后边会有提示具体是什么。
Other : 选择一个具体的编码格式。
New text file line delimiter :
Default : 选择此项将设定新建的文件换行符为系统默认的换行符。
Other : 选择一个具体的换行符样式。
换行符分别有：
Windows : CRLF 0D0A 1310 \r\n (Carriage Return/Line Feed)
Unix/Linux : LF 0A 10 \n
Mac OS : CR 0D 13 \r
编码格式设定将影响新建的文件和修改保存后的文件。
换行符设定只影响新建的文件，修改后保存将延续文件保存之前的换行符设定。
修改已存在文件的编码格式：
选择文件或文件夹 -> Properties -> Resource -> Text file encoding
修改已存在文件的换行符：
选择文件或文件夹 -> File -> Convert Line Delimiter To
原文：http://www.cnblogs.com/wuyun-blog/p/6972667.html