代码说明：
使用单个蛋白质的txt计算PSSM生成的结果为单个的PSSM文件。
但是由于一些原因（如蛋白质序列过长），会导致一些蛋白质txt文件无法计算出pssm,为了找到这些没有计算出pssm的蛋白质序列，写出一下代码：
import java.io.File; /* * 找到没计算出PSSM的文件，并输出文件名。 */ public class find_Nullpssm { public void searchFile(String Path) { int N = 25103; int count = 0; for (int i = 1; i <= N; i++) { String road = Path + i + ".pssm"; File file = new File(road); if (!file.exists()) {// 存在时,返回true1 System.out.println(i); count++; } } System.out.println(count); } public static void main(String[] args) { find_Nullpssm fi = new find_Nullpssm(); String Path = "E:\\experiment--help\\linglingbao\\pssm\\"; fi.searchFile(Path); } }
注：
①：isFile()
public boolean isFile()测试此抽象路径名表示的文件是否是一个标准文件.如果该文件不是一个目录,并且满足其他与系统有关的标准,那么该文件是标准文件.由Java应用程序创建的所有非目录文件一定是标准文件.
返回:当且仅当此抽象路径名表示的文件存在且是一个标准文件时,返回true;否则返回false;
抛出:SecurityException,如果存在安全管理器,且其SecurityManager.checkRead(java.lang.String)方法拒绝对文件进行读访问.
exists()
public boolean exists()测试此抽象路径名表示的文件或目录是否存在.
返回:当且仅当此抽象路径名表示的文件或目录存在时,返回true;否则返回false;
抛出:SecurityException如果存在安全管理器,且其SecurityManager.checkRead(Java.lang.String)方法拒绝对文件或目录进行写访问.
原文：http://www.cnblogs.com/yumiaomiao/p/7136346.html