1. hibernate是全自动的ORM映射框架，而mybatis是半自动的。
2.sql直接优化上，mybatis要比hibernate方便很多。
3.hibernate数据库移植性远大于mybatis。
hibernate通过它强大的映射结构和hql语言，大大降低了对象与数据库（Oracle、MySQL等）的耦合性，而mybatis由于需要手写sql，因此与数据库的耦合性直接取决于程序员写sql的方法，如果sql不具通用性而用了很多某数据库特性的sql语句的话，移植性也会随之降低很多，成本很高。
4.Hibernate有更好的二级缓存机制，可以使用第三方缓存。mybatis二级缓存机制不佳。
原文：http://www.cnblogs.com/javatk/p/7195959.html