尝试了win下用pear安装。不明原因，装不上。
手动安装后，win下无法执行，linux下又可以执行。
直接访问：
https://github.com/phpDocumentor/phpDocumentor2/releases
下载过后解压缩。
需要在linux下执行，目录是phpDocumentor-2.9.0/bin
./phpdoc -d /home/your/导出注释的文件夹 -t /home/your/docs
原文：http://www.cnblogs.com/codeaaa/p/7366558.html