这是一个很细节也很实际的问题，到底用哪个版本？
参考：
What Ensembl genome version should I use for alignments? (e.g. toplevel.fa vs. primary_assembly.fa)
大部分都推荐使用soft-mask版本的，也就是没有把repeat替换为N。
这是一个很细节也很实际的问题，到底用哪个版本？
参考：
What Ensembl genome version should I use for alignments? (e.g. toplevel.fa vs. primary_assembly.fa)
大部分都推荐使用soft-mask版本的，也就是没有把repeat替换为N。
原文：https://www.cnblogs.com/leezx/p/8646225.html