blatSrc35.zip下载地址：http://users.soe.ucsc.edu/~kent/src/
对于下载好的源代码安装包blatSrc35.zip，需进行编译,安装过程如下：
1.用unzip blatSrc35.zip 解压缩包；
2.bash：cd blatSrc 进入blatSrc文件夹下(此后直到设置环境变量，都在blatSrc文件夹下操作)；
3.bash：uname -a 查看linux系统类型，我的系统是x86_64 GUN/LINUX;
4.bash：export MACHTYPE=x86_64 回车；
5.bash：mkdir -p ~/bin/x86_64 回车；
6.bash：make 回车；
7.设置环境变量：主目录下（/home/wq） bash:vim .bashrc;
8.按”i”，编辑文档，最后行输入：export PATH=/home/wq/bin:$PATH，编辑完成后Esc，：，wq，回车；
9.bash：source .bashrc更新环境变量。
至此blat安装完毕 bash:blat *.fa **.fa 回车即以**.fa为 母库比对。
linux_x86_64 blat安装,布布扣,bubuko.com
原文：http://www.cnblogs.com/wq242424/p/3850814.html