InnoDB
1）虽然不支持用户创建聚族索引，但InnoDB会对主键建立聚簇索引。如果你不指定主键，InnoDB会用一个具有唯一且非空值的索引来代替。如果不存在这样的索引，InnoDB会定义一个隐藏的主键，然后对其建立聚簇索引。一般来说，DBMS都会以聚簇索引的形式来存储实际的数据，它是其它二级索引的基础。在InnoDB中采用自增主键能获得更好的效率。
2）使用行级锁
3）支持并发
4）支持事务
5）比MyISAM有更好的安全性
MyISAM
1）不支持用户创建聚族索引，自身也不会使用聚族索引存储。
2）仅支持表级锁
3）不支持事务
4）查询效率比InnoDB高
5）支持全文索引、空间索引
MySQL的InnoDB和MyISAM比较,布布扣,bubuko.com
MySQL的InnoDB和MyISAM比较
原文：http://www.cnblogs.com/YESheng/p/3859829.html
