关于生物项目上的blast和viroblast

最近要做一个跟生物有关的项目，隔行如隔山呀，好多工具以前都没听过，blast分到我头上啦，查查，查查

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。

这个链接下有很多加入了blast功能的生物网站：https://www.plob.org/article/6674.html，

blast官网：

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=DeveloperInfo

百度说blast自己写前端展示页面，用命令行查结果，后找到viroblast，Sequenceserver 等开源的码可以直接使用，链接：https://blog.csdn.net/weixin_40099163/article/details/83304704。

我选择了viroblast，小麦研究联盟  的教程也很简单。下载viroblast源码，解压到wampserver的www文件夹下打开就可以看到原始页面了，

然后就是添加需要的数据库，在blast官网下载相关数据库，解压后放在db文件夹下，蛋白数据库和基因组数据库要分别放在protein和nucleotide文件夹下。

接着配置viroblast.ini文件就可以了：

=>前是数据库名称，后是显示在页面上的名称。添加过后如图：

最后可以根据需要改一下php页面。

还在学习中，不知道步骤正不正确的，查询也还需要生物方面的人来查一下，后续再更

关于生物项目上的blast和viroblast

原文：https://www.cnblogs.com/lian-dong/p/10407910.html