两个引擎都是使用B+tree 数据结构作为索引
不同点：
1、INNODB的主键必须要有，同时也是聚集索引，INNODB的数据文件本身就是索引文件；而MYISAM则是存储了数据的地址
2、INNODB的辅助索引，会存储主键的地址（所以建议不要把主键的长度设置过大，一般用自增的数字即可），使用辅助索引搜索的时候，也是先关联到主键，在使用主键进行查询；而MYISAM 的辅助索引跟主键没有任何区别，只是主键唯一，辅助索引不唯一而已。
3、INNODB 支持事务；MYISAM 不支持事务
4、INNODB是行锁；MYISAM 是表锁
原文：https://www.cnblogs.com/drafire/p/10665009.html