ALCON是PacBio公司开发的一款用于三代基因组De novo组装软件, 更适合于大基因组的组装。
FALCON的结果文件：
0-rawreads/ 该目录存放对raw subreads进行overlpping分析与校正的结果； 0-rawreads/cns-runs/cns_*/*/*.fasta存放校正后的序列信息。 1-preads_ovl/ 该目录存放对校正后reads进行overlapping的结果； 2-asm-falcon/ 该目录是最终结果目录，主要的结果文件是p_ctg.fa和a_ctg.fa。
参考来源：http://www.chenlianfu.com/?p=2755
原文：https://www.cnblogs.com/bio-mary/p/11758416.html