首页 > 其他 > 详细

How to alignment by MAFFT

时间:2019-11-30 12:55:08      阅读:113      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

MAFFT比对快速且准确,常用做序列之间比对。

MAFFT官方下载地址

https://mafft.cbrc.jp/alignment/software/

下载适合自己电脑的MAFFT版本,打开mafft.bat,操作界面如下:

 技术分享图片

将需要比对的FASTA格式的文件(以filename.fas为例)放入MAFFT根目录文件夹(我的是mafft-win)中,在@后输入文件名filename.fas,如下:

 技术分享图片

回车,输入 输出的文件名(这里命名为filename1.fas),如下:

 技术分享图片

回车,输入4(设置输出文件格式为Fasta format),如下:

 技术分享图片

回车,输入1(一般设置alignment策略为自动),如下:

 技术分享图片

回车。接着设置附加参数,但是一般不设置附加参数,可直接再回车,如下:

 技术分享图片

 

 技术分享图片

输入Y后,回车,开始比对。中途若停止,按住Enter键,直至比对完。比对完的文件也保存于根目录中。

 技术分享图片

 

 技术分享图片

 

 技术分享图片

How to alignment by MAFFT

原文:https://www.cnblogs.com/laolululu/p/11961989.html

(0)
(0)
   
举报
评论 一句话评论(0
关于我们 - 联系我们 - 留言反馈 - 联系我们:wmxa8@hotmail.com
© 2014 bubuko.com 版权所有
打开技术之扣,分享程序人生!