建库中有一步是:
PCR扩增加了接头的DNA片段。
理想情况下,对打碎的基因组DNA,每个DNA片段测且仅测到一次。
但这一步扩增了6个cycle,那么每个DNA片段有了64份拷贝。将扩增后所有产物“洒”到flowcell,来自一个DNA片段的两个拷贝,可能会锚定在两个bead上,经过测序得到的这两条read,就是PCR duplication。
一般来说,如果PCR duplication rate过高,那么同样总数目的reads,所提供的关于基因组的信息就大大减少了
原文:https://www.cnblogs.com/bio-mary/p/12053346.html