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测序的PCR duplicates

时间:2019-12-17 12:05:59      阅读:137      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

 

建库中有一步是:

PCR扩增加了接头的DNA片段。

 

理想情况下,对打碎的基因组DNA,每个DNA片段测且仅测到一次。

 

但这一步扩增了6个cycle,那么每个DNA片段有了64份拷贝。将扩增后所有产物“洒”到flowcell,来自一个DNA片段的两个拷贝,可能会锚定在两个bead上,经过测序得到的这两条read,就是PCR duplication

一般来说,如果PCR duplication rate过高,那么同样总数目的reads,所提供的关于基因组的信息就大大减少了




参考来源:https://www.jianshu.com/p/73483070379b

测序的PCR duplicates

原文:https://www.cnblogs.com/bio-mary/p/12053346.html

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