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R splatter包学习

时间:2020-02-01 23:28:04      阅读:428      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

转自:http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/splatter/inst/doc/splatter.html

1.quickstart

library(splatter)
library(scater)# 创建模拟数据
set.seed(1)
sce <- mockSCE()
params <- splatEstimate(sce)

跑上面的代码时,出现了Error in mockSCE() : could not find function "mockSCE" 错误,emmm。

这个函数是scater包里的函数,引入了这个包为啥找不到函数呢。

可能是和R的版本有关系,我目前使用的是3.5.1,但有warning:

Warning messages:
1: 程辑包‘scater’是用R版本3.5.2 来建造的 
2: 程辑包‘ggplot2’是用R版本3.5.3 来建造的 

所以尝试使用3.5.2版本的R。

 

R splatter包学习

原文:https://www.cnblogs.com/BlueBlueSea/p/12250532.html

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