Circos绘图—基础

之前看过一张关于人口迁徙的图，感觉很惊艳，后面了解到Circos这个工具，虽然主要是用于染色体基因组的图的绘制，但是在其他方面也是有着很好的可视化效果

汽车交易中的用户行为模式追踪

How do customers "flow" between brands and car segments?

 城市规划

 人类迁移模式

 政治辩论

 1 网页可视化绘制

http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/    准备好其标准的txt文件，上传后可视化，较为简单

 上传txt文件：（格式参考：http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/samples/）

 2 代码绘制

可以自定义化的东西比较多 

1.安装circos与Perl

为了能运行circos，还需安装Perl，它是一种解释性语言，我们不需要了解这种语言

Windows用户应该下载 Strawberry Perl 或者 ActiveState Perl.

此外下载细节可以在 Perl and Modules section 中了解

 circos没有用户界面，所有操作都是在命令行进行，在UNIX和Windows系统均可运行

在命令检验是否安装好：

下载circos http://circos.ca/software/download/

选择最新版本即可 直接解压下载

 Windows 用户需要先运行 perl ，再使用 circos脚本作为参数输入

2.运行circos

先运行 perl 再将 Circos 脚本文件作为参数，和命令行一起

在命令行将目录设为circos下载的目录

perl bin\circos -modules  # 检查perl模块是都有缺失

未完待续.......

参考：

http://circos.ca/intro/general_data/  多种领域应用

http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/samples/ 案例图

http://www.circos.ca/software/download/circos/ 主页下载

http://genomevisualization.com/documentation/tutorials/configuration/distribution_and_installation/ 安装运行

 http://genomevisualization.com/documentation/tutorials/configuration/runtime_parameters/

Circos绘图—基础

原文：https://www.cnblogs.com/icydengyw/p/12310060.html