使用sratoolkit下载NCBI数据

如何使用sratoolkit下载NCBI数据？
比如我想下载这个研究的数据，

使用prefetch命令，输入对应的SRA号码
prefetch SRR10861695

默认下载限制是20G的数据，如果下载的数据较大，可以修改配置，比如改为最大100G
prefetch --max-size 100G SRR10861695

如何修改默认配置，特别是下载数据的存放位置
vdb-config -i

进入这个界面，需要按照指示操控键盘进行修改

如果上面这个配置感觉很慢，可以考虑用文本交互的方法，命令是
vdb-config -i --interactive-mode textual

如图，如果修改存储位置，输入4，回车即可。

使用sratoolkit下载NCBI数据

原文：https://www.cnblogs.com/artesian0526/p/12666509.html