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Variation Revealed by SNP Genotyping and Morphology Provides Insight into the Origin of the Tomato

时间:2020-05-13 15:44:01      阅读:58      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

Table of Contents

  1. Abstract
  2. 结论
    1. 遗传结构
    2. 其他
  3. 讨论
    1. 分类
    2. 遗传和形态多样性
    3. 樱桃番茄多样性结构
    4. 栽培番茄的起源和扩散
    5. 樱桃番茄的起源和扩散

Abstract

樱桃番茄和栽培番茄以及醋栗番茄之间的进化关系一直有争议。有的作者认为樱桃番茄是两者的中间种,有的作者认为樱桃番茄是两者的混合品种。为了探索这个问题,作者使用 SolCap 平台(包含 7,414 SNPs)对 272 个家系进行了鉴定。

结论

遗传结构

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Figure1:所有结果的主成分分析

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Figure2:只包含栽培番茄和樱桃番茄的主成分分析

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Figure3 和 Figure4:分地区的结构分析

其他

接下来,作者从气候、多样性和形态三个角度分别解析。

讨论

分类

作者从不同角度讨论了材料可能的分类。

遗传和形态多样性

作者讨论了醋栗番茄、栽培番茄和樱桃番茄的多样性。醋栗番茄的多样性明显与地理位置有关。栽培番茄的多样性小于其他 group。樱桃番茄的遗传多样性和形态多样性高。

樱桃番茄多样性结构

即使 PCA 分析中,和栽培番茄与醋栗番茄相比,樱桃番茄表现出连续性,但是也有一些子结构。
醋栗番茄主要分布在西安第斯山脉,但是醋栗番茄和樱桃番茄和混合材料主要分布在安第斯山脉西低地,尤其是南秘鲁。这需要进一步研究解释。
尽管樱桃番茄的混合材料十分丰富,但是并不是所有都是杂交的结果。
根据樱桃番茄的混合材料以及表现出的地理结构,我们可以假设混合过程在安第斯山脉发生了很长时间。缓慢到保留了可以观察到的地理分化。

栽培番茄的起源和扩散

对于前述的两种樱桃番茄和醋栗番茄关系的假说,现有的数据支持樱桃番茄起源于醋栗番茄的假说。
当樱桃番茄出现在厄瓜多尔的时候,它可能已经作为野生植物或者由于人类行为迁移到了中美洲。

樱桃番茄的起源和扩散

介绍了另外两种假说。一种认为 Lycopersicon humboldtii (Willd.) Dunal 是栽培番茄的祖先。另一种假说提出樱桃番茄是栽培番茄和野生番茄的混合种(尽管该研究中的数据也支持樱桃番茄起源假说)。
考虑到厄瓜多尔的樱桃番茄,作者认为番茄早期驯化发生在安第斯山脉。但是还缺乏更强力的证据证明。
之后,西班牙人抵达中美洲,发现了栽培番茄并将之传播。不过,直到今天,番茄的驯化尚未结束。

Variation Revealed by SNP Genotyping and Morphology Provides Insight into the Origin of the Tomato

原文:https://www.cnblogs.com/flyingicedragon/p/12882102.html

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