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ATAC-seq数据的accessibility

时间:2020-08-27 21:40:06      阅读:92      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

如何定义一个区域的开放程度(accessibility):

染色体是盘曲折叠的一个存在,那么有功能的区域就不能缠绕过紧(缠绕太紧TF就binding不上去了),也就是说有功能的区域更开放,更裸露。

这样一来我们就需要找那个区域是更开放的也就是accessibility高,ATAC-seq 就是用来找到细胞中开放的DNA并把这个序列记录下来。

那么真正开放的区域在很多细胞里都会保留下来,这些序列累积起来就变成一个peak,这个peak越高,开放性就越高。

 

ATAC-seq数据的accessibility

原文:https://www.cnblogs.com/kaya-yuan/p/13573973.html

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