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IGEM_Paper阅读(暑假)

时间:2021-02-21 23:30:47      阅读:33      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]

三篇Paper

1.Rolling-Circle RNA Synthesis Circular Oligonucleotides as Efficient Substrate for T7 RNA Polymerase

1995、关键词:Circular Oligonucleotides

摘要:
小单链环状寡核苷酸作为RNA序列起始和延伸模板的报告。缺少添加的RNA引物和使用聚丙烯酰胺凝胶电泳进行相关实验。最近的研究表明,RNA合成可以在某些情况下是针对具体的结构而不是针对特定的核苷酸序列。双链DNA中的单链“气泡”区域也可以作为RNA合成的起始位点,有人提出了这样的“气泡”结构模仿由聚合酶形成的开放转录复合体。小圆形单链寡核苷酸可以作为有效的模板RNA序列的起始和延长,这发生在没有添加RNA引物的情况下,没有RNA的启动子序列,在缺乏任何双重构造。合成的环状dna比酶本身要小得多,但它们可以作为高效的模板,用于生产长度为数千个核苷酸的重复RNA序列。

个人总结:
1.线性模板和圆形模板之间的巨大区别值得注意,因为有报道称线性寡核苷酸以一种“滚动”机制作为RNA合成的模板。2.简单弯曲的合成DNA寡核苷酸显然不足以合成RNA。

2.The 8-Nucleotide-long RNADNA Hybrid Is a Primary Stability

2000、关键词:The 8-Nucleotide-long RNA

摘要:
基于对RNA聚合酶的广泛研究,转录连续滑动钳模型表明,稳定延伸复合体的形成需要两种不同的核酸成分:一个8 - 9 nt的转录模板杂交体,以及杂交体下游的双链DNA。在这里,我们通过开发一种独立于启动子的酵母RNA聚合酶功能扩展复合物组装方法来解决真核生物中持久扩展复合物的最小组成

个人总结:

  1. E. coli RNA polymerase 和 S. cerevisiae Pol II 形成ECs稳定性要求有很大的不同 2.模型的主要预测是RNA:DNA杂交的长度可能是调节转录连续性的一个靶点。

3.Rolling circle transcription on smallest size double stranded DNA minicircles

2010、RNA polymerase RNAP T7 DNA nanotechnology molecular motor real time monitoring of transcription 2’ O methyl RNA molecular beacon minicircle

研究T7 RNA聚合酶对小DNA圈的作用,小到100个碱基对,为将来可能应用于DNA纳米马达。虽然以前人们知道小DNA圈的滚动圈转录是可能的,但部分单链圈牺牲了使用DNA作为结构材料的一些有利特性。为了研究DNA纳米环的转录,解决了许多关于模型设计和检测系统的问题并给出了答案

1.RNAP T7是一种小的单亚基噬菌体RNA聚合酶,以其高启动子特异性、不需要外部转录因子和非常高的加工性而引人注目 2.与单链RNA结合的作用取决于一种结构的形成,这种结构可能模仿在正常启动子依赖性转录开始时发生的起始气泡。

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原文:https://www.cnblogs.com/lightac/p/14426024.html

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