一、平台支持：
1、Personal Geodatabase：仅可在Windows 上运行；
2、File Geodatabase：跨平台支持，可在Windows 及UNIX、linux上运行。
评价：这是个非常大的亮点，使得数据可以更好的移植。
二、存储方式：
1、Personal Geodatabase 是一个Microsoft-Access 的 .mdb 数据库文档；
2、File Geodatabase 以一个文件夹方式储存,包括 IBM DB2, Informix, Oracle(有或没有Oracle Spatial都可以)和 SQL Server。
评价：Personal Geodatabase有依托微软的access数据库的限制，File Geodatabase，可以慢慢摆脱依靠access的限制，不用受制与微软的技术。
三、存储限制：
1、Personal Geodatabase：相同于MS Accesss 限制，数据库最大容量为2GB。
2、File Geodatabase：数据库无限制，每个表限制为1TB(1000GB)。
评价：File Geodatabase支持对海量数据的处理。
四、储存空间：
同样的资料，在File Geodatabase 中比Personal Geodatabase 和Shapefile占用的硬盘空间更少，通常可以减少50%~70%，最多可减少到1/5。
五、效能：
File Geodatabase 相较于Personal Geodatabase 处理数据的速度可快20%到10倍，这部分随着资料量的增加，效能差异越大。
六、是否支持数据压缩：
1、Personal Geodatabase：不支持数据压缩。
2、File Geodatabase：支持一种新的数据压缩格式，在查询与显示方面均与未压缩格式相同，压缩比率可从2:1 到25:1。
Arcgis - Personal Geodatabase 和 File Geodatabase的区别.
原文：http://www.cnblogs.com/listened/p/4036431.html