方法一：使用SQL语句命令UPDATE
需用到Mysql自带的加密函数PASSWORD(string)，该函数对一个明文密码进行加密，但不能解密。专门用于mysql.user(用户权限表)中设置密码，命令如下：
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mysql> use mysql
Database changed
mysql> update user set password=password(‘123456‘) where user=‘root‘;
Query OK, 1 row affected (0.00 sec)
Rows matched: 1 Changed: 1 Warnings: 0
mysql> flush privileges;
Query OK, 0 rows affected (0.01 sec)
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注意：在使用update后，需要进一步输入flush privileges来刷新MySQL的系统权限相关表，否则会出现拒绝访问。或者重新启动mysql服务器，来使新设置生效。若需要设置Mysql的root密码为空，则可不使用PASSWORD函数（用了也等于没用）。通用格式：
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update mysql.user set password=PASSWORD(‘新密码’) where User=’root’;
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方法二：使用set password命令
首先确保进入mysql，并使用mysql库，即命令“use mysql;”，然后运行如下命令：
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mysql> set password for ‘root‘@‘localhost‘=password(‘miao‘);
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)
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原文：http://www.cnblogs.com/wawahaha/p/4495334.html