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python批量处理

时间:2015-06-20 23:21:41      阅读:315      评论:0      收藏:0      [点我收藏+]
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Sat Jun 20 19:36:34 2015

@author: chaofn
"""
import os

"""
这个程序的目的是将linux下/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb目录中的所有文件(一共有215个文件)
批处理
将pdb文件生成dssp文件

"""
#listdir返回文件名的列表
fileLine=os.listdir(/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb)
#遍历整个列表
for i in range(len(fileLine)-1):
    #将字符串用变量表示
    input_file=/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb/+fileLine[i]
    #先去掉文件名的后缀,然后形成后缀为dssp的文件名
    out_file=fileLine[i].split(.)[0]+.dssp
    output_file=/ifs/home/fanchao/Manesh_dssp/+out_file
    #注意:参数的传递(先是%s,然后是%变量名),多个变量的传入要用元组表示,在元组前用%
    os.system(/ifs/share/lib/dssp/dssp2 -i %s -o %s %(input_file,output_file))

 

python批量处理

原文:http://www.cnblogs.com/chaofn/p/4591113.html

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